ImageJ – un logiciel pour analyser et traiter les fichiers graphiques. Le logiciel est capable d’analyser efficacement les images et d’obtenir les données techniques détaillées. ImageJ supporte la plupart des formats graphiques et a un ensemble d’outils pour l’édition. Le logiciel permet d’effectuer les différentes transformations géométriques, de créer les histogrammes de densité, d’effectuer la visualisation en trois dimensions, d’effectuer des opérations logiques et arithmétiques entre des images, etc. ImageJ est capable de travailler simultanément avec plusieurs images, d’appliquer les différents filtres et d’effectuer le traitement par lots de fichiers. ImageJ contient beaucoup d’extensions qui améliorent considérablement les possibilités de logiciel.